Фильтровать по полю, поставив в настройках пользовательского поля "Город (справочник) галочку "показывать в фильтре", не получится из-за технических особенностей данного типа поля.
Но есть решение, которое все же позволит фильтровать по этому полю. Необходимо создать шаблон бизнес-процесса с автоматическим запуском при добавлении и при изменении, который поможет перенести значение из поля "Город (справочник)" в другое поле. См. пример ниже
Рекомендуем, чтобы второе поле, куда будет перенесено значение из поля "Город (справочник)" , было текстовым.
Результат: в поле "Город из справочника" записано значение поля "Город (справочник)"
По полю "Город из справочника" можно фильтровать сделки